Komunisti ho vo väzení týrali, on sa nepoddal. Pápež predstavil verejnosti nového blahoslaveného Slováka
Slávnostný úkon jeho blahorečenia sa uskutočnil v sobotu.
Najskôr ho odsúdili na desať rokov väzenia za vlastizradu. Trest mu potom sprísnili o jeden rok za misijnú službu medzi spoluväzňami. Pracoval v jáchymovských uránových baniach, potom bol väznený v Ruzyni, kde sa stal terčom psychického týrania.
Zomrel na následky týrania
Po odpykaní trestu ho s vážne podlomeným zdravím prepustili v októbri 1962 na slobodu. Zomrel 27. decembra 1965 v Skalici na následky psychickej a fyzickej tyranie vo väzení. Odpykal si 11 rokov väzenia za vlastizradu a misijnú službu medzi spoluväzňami.
Slávnostný úkon jeho blahorečenia sa uskutočnil v sobotu (31. 8.) pred Bazilikou Sedembolestnej Panny Márie v Šaštíne-Strážach (okres Senica). Pápež František schválil už vlani v decembri dekrét o mučeníctve Havlíka na základe výsledkov diecéznej a rímskej fázy procesu blahorečenia.